Idioma
Java
Tipo de ferramenta
Aplicativo web
Licença
Apache License, Version 2.0
Version
23.10
National Microbiology Laboratory
IRIDA é uma plataforma canadense de testes de doenças infecciosas projetada para epidemiologia genômica, apoiando laboratórios de saúde pública e microbiologia clínica em todo o mundo. Usando o sequenciamento completo do genoma, o IRIDA transforma métodos de Big Data em ferramentas acessíveis para diagnóstico e estudos de surtos. Este software intuitivo e poderoso facilita a transição de novos métodos epidemiológicos do laboratório para a linha de frente, tornando a genômica de doenças infecciosas acessível a um amplo espectro de profissionais.
IRIDA aborda a complexidade e acessibilidade da epidemiologia genômica, fornecendo uma plataforma intuitiva e poderosa que facilita o uso do sequenciamento completo do genoma na saúde pública. Esta ferramenta é essencial para modernizar os programas de vigilância e diagnóstico de doenças infecciosas.
Processamento de dados do pipeline: simplifica o processamento de dados genômicos por meio de pipelines personalizados. Gerenciamento de resultados: manuseio eficiente e atualização dos resultados derivados das análises de bioinformática. Integração do Galaxy: suporta integração com a plataforma Galaxy para obter recursos aprimorados de análise de dados. Arquitetura de software modular: permite personalização e escalabilidade nas tarefas de processamento de dados. Armazenamento de dados seguro: implementa mecanismos robustos para armazenar e gerenciar dados genômicos. Autenticação e segurança do usuário: garante acesso seguro e proteção de dados.
Projeto em Java com organização estruturada de pacotes. Segue convenções de desenvolvimento empresarial e práticas sólidas de gerenciamento de recursos e testes.
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A imagem apresenta uma página que explica o projeto integrado de análise de doenças infecciosas e rápidas (IRIDA), destacando componentes como gerenciamento de dados, pipelines de análise, integração de dados, visualização e ferramentas.
Esta imagem exibe o fluxo de trabalho da plataforma Irida, mostrando o fluxo de fontes de dados através do processamento e armazenamento, com módulos para controle de qualidade, API, análise e visualização atendendo diversos usuários finais.
Esta imagem mostra uma interface do usuário com uma tabela listando amostras de Salmonella enterica, incluindo detalhes como nome de amostra, projeto associado e datas de criação/modificação.
Plataforma web projetada para tornar a genômica de doenças infecciosas acessível a epidemiologistas, microbiologistas clínicos e à comunidade de pesquisa em geral.
Informações sobre a plataforma IRIDA e suas funcionalidades.