Idioma
Java
Tipo de herramienta
Aplicación web
Licencia
Apache License, Version 2.0
Versión
23.10
National Microbiology Laboratory
IRIDA es una plataforma canadiense de análisis de enfermedades infecciosas diseñada para la epidemiología genómica, apoyando a laboratorios de salud pública y microbiología clínica a nivel mundial. Utilizando secuenciación de genoma completo, IRIDA transforma los métodos de Big Data en herramientas accesibles para diagnósticos y estudios de brotes. Este software intuitivo y potente facilita la transición de nuevos métodos epidemiológicos del laboratorio a la línea de frente, haciendo la genómica de enfermedades infecciosas accesible a un amplio espectro de profesionales.
IRIDA aborda la complejidad y accesibilidad de la epidemiología genómica, proporcionando una plataforma intuitiva y potente que facilita el uso de secuenciación de genoma completo en la salud pública. Esta herramienta es esencial para modernizar programas de vigilancia y diagnóstico de enfermedades infecciosas.
Procesamiento de datos de tuberías: optimiza el procesamiento de datos genómicos a través de tuberías personalizadas. Gestión de resultados: manejo eficiente y actualización de resultados derivados de análisis bioinformáticos. Integración de Galaxy: admite la integración con la plataforma Galaxy para mejorar las capacidades de análisis de datos. Arquitectura de software modular: permite la personalización y escalabilidad en las tareas de procesamiento de datos. Almacenamiento de datos seguro: implementa mecanismos robustos para almacenar y administrar datos genómicos. Autenticación y seguridad del usuario: garantiza un acceso seguro y protección de datos.
Proyecto en Java con estructura organizada en paquetes. Utiliza convenciones de desarrollo empresarial y prácticas sólidas de gestión de recursos y pruebas.
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La imagen presenta una página que explica el proyecto Integrated Rapid Infectious Disease Analysis (IRIDA), destacando componentes como la Gestión de Datos, Pipelines de Análisis, Integración de Datos, Visualización y Herramientas.
Esta imagen muestra el flujo de trabajo de la plataforma Irida, que muestra que las fuentes de datos fluyen a través del procesamiento y el almacenamiento, con módulos para control de calidad, API, análisis y visualización que sirven a varios usuarios finales.
Esta imagen muestra una interfaz de usuario con una tabla que enumera muestras de Salmonella enterica, incluidos detalles como el nombre de la muestra, el proyecto asociado y las fechas de creación/modificación.
Plataforma web diseñada para hacer accesible la genómica de enfermedades infecciosas a epidemiólogos, microbiólogos clínicos y la comunidad investigadora en general.
Información sobre la plataforma IRIDA y sus funcionalidades.